Ciała Statutowe Stowarzyszenia KoLiber stanowią: Konwent, Prezes, Zarząd Główny, Rada Krajowa, Centralna Komisja Rewizyjna oraz Sąd Naczelny. Konwent jest najwyższą władzą Stowarzyszenia. Prezes reprezentuje formację na zewnątrz. Zarząd Główny kieruje działalnością organizacji. Rada Krajowa uchwala strategię działania Stowarzyszenia. Centralna Komisja Rewizyjna kontroluje finanse, interpretuje Statut oraz rozpatruje spory między członkami organizacji.
